検索ワードをかえてみるものですね。
『MovableType テンプレート 保存場所』
とかで検索してたら、全然出てこないので困り果ててました。そこで、素直に『movable type モジュール どこに保存されている』で検索をかけたら、速攻で出てきました(笑
保存されている場所がどうこうというより、リンク機能を使ってバックアップのようにして保存してしまえ!ってことみたいです。
任意のフォルダに保存できるし、非常に楽でした。さ~これで、また一つ使いやすくなったぞ~(MTの専用タグを使わない限り、絶対にこっちの方が制作・修正が楽だ!)